Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3CA6NKF2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms