Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAF6Q9Y4K3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms