Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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