Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms