Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms