Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms