Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms