Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms