Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms