Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms