Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms