Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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