Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms