Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms