Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms