Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms