Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3IPQ96QF0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3IPQ96QF0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms