Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPR78Q96P69 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPR78Q96P69 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPR78Q96P69 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPR78Q96P69 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPR78Q96P69 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms