Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT43Q96FT9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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