Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms