Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC9Q8NEP7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms