Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms