Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms