Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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