Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q7L0L9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q7L0L9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q7L0L9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q7L0L9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms