Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms