Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms