Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms