Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3L3Q68CJ9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms