Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms