Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms