Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TWISTNBQ3B726 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms