Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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