Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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