Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms