Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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