Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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