Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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