Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms