Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms