Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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UBE3CQ15386 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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UBE3CQ15386 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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UBE3CQ15386 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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