Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NCAPHQ15003 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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