Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264 ms