Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms