Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C1orf61Q13536 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C1orf61Q13536 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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C1orf61Q13536 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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