Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CCL7-201ENST00000378569 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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