Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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