Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms