Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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ANK3Q12955 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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ANK3Q12955 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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