Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXF2Q12947 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXF2Q12947 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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